Desde el lanzamiento de la versión 0.41 el eMule funciona con 2 redes – la clásica red ed2k basada en servidores y la topología completamente nueva sin servidores basada en Kademlia. En esencia ambas redes tienen las mismas funciones. Ambas proveen de diferentes medios de búsqueda de otros usuarios o archivos que estás esperando para descargar.
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